Johto apareceu em Pokémon Ouro & Prata & Pokémon Cristal e está a Oeste de Kanto. Possui uma nova Liga Pokémon e várias áreas especiais. A Equipe Rocket também está aqui, mas em força menor. No mangá, há uma outra organização: o Neo Team Rocket.

No anime, a 3ª, 4ª e a 5ª temporadas se passam aqui.

A Tin Tower (Japonês: スズ の とう Tin Tower)é um local de Johto em Ecruteak City. Como a Torre Brass é coberta com painéis dourados, os painéis da Tin Tower são de prata-colorida. Ho-oh ex empoleiradas em cima desta torre, mas quando a Brass Tower queimou, ele voou para longe, em busca de um treinador de puro coração. Nos Pokémons HeartGold & SoulSilver, esta torre é chamada de Bell Tower.

Nas versões Gold, Silver, HeartGold e SoulSilver, o treinador finalmente chega na Tin Tower tendo a Rainbow Wing.Neste ponto, o jogador será autorizado a subir os oito restantes níveis da torre, até o teto, onde Ho-Oh se espera. No entanto, em Pokémon Crystal, jogadores com um Clear Bell será capaz de capturar Suicune aqui, e só depois de pegar cada uma das bestas lendárias, será um treinador capaz de subir os passos acima do primeiro andar para chegar ao Ho-Oh.